为提高爱国卫生工作信息化管理水平，推动全省爱国卫生工作规范化、科学化管理，浙江省爱卫办在充分调研的基础上，从2010年开始组织开发全省爱国卫生管理信息系统。经过一年多时间，省、市、县三级联网的爱国卫生管理信息系统正式启用，在全国尚属首家。

浙江省爱国卫生信息系统根据本省爱国卫生工作的实际情况，在实现各项历史数据录入的基础上，数据采集与填报均实现底层数据录入，用户只能录入相应的原始数据，所有需要统计、汇总的数值均由信息系统自动计算生成且无法直接修改，既保证了数据统计的准确性，又减少人工计算出现错误的概率，也杜绝了手工修改调整有关数据的可能性，确保各项数据资料的真实可靠。

目前，浙江省爱国卫生信息系统分为数据管理、OA系统、FLASH地图和信息报送四个模块。其中数据管理是信息系统的核心内容，主要用于管理全省爱国卫生工作数据与信息，内容涵盖了卫生创建、农村改水改厕、健康教育、病媒生物防制等各项爱国卫生工作，并根据实际工作需要，设置了专项工作管理模块，用于管理部分阶段性项目工作数据与信息。OA系统用于省市县三级办公自动化管理，可实现公文、通知等实时传送。FLASH地图是将爱国卫生工作数据信息以地图的形式，直观的在系统中进行展示。信息报送则用于报送、审核爱国卫生工作的信息稿件。